雲南省種子植物名錄數據集

雲南省種子植物名錄數據集
作者：陳家輝　鄧濤　張代貴　樂霽培　周卓　孫露　李彥波　李文慶　史鳴明　孫航
2018年3月1日

本作品收錄於《中國科學數據》

陳家輝, 鄧濤, 張代貴, 等. 雲南省種子植物名錄數據集[J/OL]. 中國科學數據, 2018, 3(1). (2018-02-24). DOI: 10.11922/csdata.2017.18.zh.

摘要&關鍵詞

摘要：生物物種名錄是一個自然地理區域或行政區域的生物區系本底性的基礎資料，是生物多樣性研究、保護和合理利用的前提。然而各類分類學文獻所採用的觀點和分類系統可能並不一致，並且隨着植物分類學和系統學等研究的深入、新類群的不斷發表以及新記錄類群的不斷發現導致分類學處理差異。因此，生物物種名錄的編目是一個需要及時更新的動態過程。本數據集在整理《雲南植物志》《雲南種子植物名錄》《中國植物志》等各類志書、專著、報告、標本館和野外考察成果等分類學資料的基礎上，通過科學的數據處理和專家審核，按照最新的分類系統，並結合最新的研究結果，完成了雲南種子植物（2016版）編目。本數據集包括雲南省種子植物253科2392屬16064種（含種下等級，不含種下等級的物種數為14538種）。其中，雲南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級，不含種下等級的物種數為105種）；被子植物244科2 367屬15951種（含種下等級，不含種下等級的物種數為14433種）。數據集的每個名稱包括拉丁科名、中文科名、學名、中文名4個字段。雲南省種子植物名錄（2016版）數據集是迄今為止雲南省最權威、最準確的種子植物名錄，為開展雲南省種子植物的科學研究、有效保護、合理利用和管理提供了科學依據，對保護雲南省生物多樣性具有重要的意義。

關鍵詞：雲南；種子植物；名錄

Abstract & Keywords

Abstract: Species catalogue provides basic data of a biota in a natural geographical region or an administrative division, and is the premise of biodiversity research and conservation, as well as the rational utilization of botanic resources. However, because of ongoing advances of plant taxonomy and systematics research, and different taxonomist viewpoints, botanical references adopt different plant systems and taxonomy. Species catalogue therefore needs continuous updates. This study conducts a rigorous evaluation and review of the source data collected from Flora of Yunnan, Checklist of Yunnan Seed Plants, Flora of China and other taxonomic references ranging from monograph, herbarium to field investigation, through which the catalogue of seed plants in Yunnan Province (version 2016) was built. This is the most authoritative and accurate catalogue recording information of seed plants in Yunnan so far, which can not only facilitate the research, conservation, and rational utilization of seed plants, but also provide a basis for biodiversity management and policy-making. The dataset covers 16,064 species of seed plants in Yunnan, which fall to 2,392 genera under 253 families. These include 113 species of gymnosperms (including infra-species, 105 when infra-species are excluded) affiliated to 25 genera under 9 families, and 15,951 species of angiosperms (including infra-species, 14,433 when infra-species are excluded) affiliated to 2,367 genera under 244 families. The dataset consists of four parts of data: family name in Latin, family name in Chinese, species name in Latin and species name in Chinese.

Keywords: Yunnan; seed plants; catalogue

數據庫（集）基本信息簡介

數據庫（集）名稱	雲南省種子植物名錄數據集
數據作者	陳家輝、鄧濤、張代貴、樂霽培、周卓、孫露、李彥波、李文慶、史鳴明、孫航
數據通信作者	孫航（sunhang@mail.kib.ac.cn）； 陳家輝（chenjh@mail.kib.ac.cn）
地理區域	雲南（東經97°31′～106°12′，北緯21°08′～29°15′）
數據量	6.79 MB
數據格式	*.pdf
數據服務系統網址	http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/489
基金項目	雲南省環境保護廳（2016年），雲南生物物種名錄審核，530007081508006；中國科學院昆明植物研究所特色研究所服務項目（iFlora與綜合服務）；中國科學院昆明植物研究所自主部署重大專項（2016–2017年），植物全息數據庫與iFlora，KIB2016005。
數據庫（集）組成	數據集包括雲南省種子植物253科2 392屬16 064種（含種下等級）。其中，雲南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級），被子植物244科2 367屬15 951種（含種下等級）。數據內容由4部分數據組成，分別為拉丁科名、中文科名、學名、中文名。

Dataset profile

Title	The catalogue of seed plants in Yunnan Province
Data authors	Chen Jiahui, Deng Tao, Zhang Daigui, Le Jipei, Zhou Zhuo, Sun Lu, Li Yanbo, Li Wenqing, Shi Mingming, Sun Hang
Data corresponding authors	Sun Hang (sunhang@mail.kib.ac.cn) Chen Jiahui (chenjh@mail.kib.ac.cn)
Geographical scope	Yunnan Province (E97°31′～106°12′，N21°08′～29°15′)
Data volume	6.79 MB
Data format	*.pdf
Data service system	http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/489
Sources of funding	Cataloguing of Yunnan Biota, Environmental Conservation Department of Yunnan (2016) (530007081508006); Project of Integrated Service and iFlora of the Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences; Plant Big Data Platform and iFlora of the Kunming Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences (KIB2016005).
Dataset composition	This dataset covers seed plants of 16,064 species (including infraspecies) affiliated to 2,392 genera under 253 families, including 113 species of gymnosperms affiliated to 25 genera under 9 families, and 15,951 species of angiosperms affiliated to 2,367 genera under 244 families. The dataset includes information on the plants』 family name in Latin, family name in Chinese, species name in Latin, and species name in Chinese.

引 言

雲南獨特的地理位置、複雜的地形地貌和多樣的生態環境為不同生態需求的植物提供了廣袤的生存空間，其素有「植物王國」的美譽，被認為是世界三個生物多樣性熱點地區即喜馬拉雅地區、中國西南山地、印度—馬來的交匯帶，受到世界極大關注^[1][2]。依據萬本太等^[3]提出的生物多樣性綜合評價等級，雲南當之無愧位列「優級」。就全國範圍而言，雲南省的生物多樣性編目工作走在了前列，持續受到國內外植物學家和環境保護工作者的高度關注^[4]。隨着近年來雲南省生物多樣性調查和研究的深入，大量的新分類群被發現並發表，其中大部分為新種，部分為新屬，甚至還有通過研究提升為新科的類群，如節蒴木科（Borthwickiaceae）^[5]。據我們的不完全統計，近年來，在雲南每年約有20個新物種被發現或描述。

近20年來，植物分類學和系統學研究不斷取得新的進展，基於分子系統學研究的被子植物APG系統（I-IV）被提出並不斷完善，Christenhusz等人提出了一個裸子植物的新系統（簡稱「克氏系統」）^[6][7]。但對於分類系統以分子證據為主還是以形態證據為主的爭議並沒有停止。同時，生物多樣性編目研究的深入，包括《雲南植物志》等志書記載的大量科、屬和種範圍界定和系統位置發生變化，小科屬的合併、大科屬的拆分，以及種在科屬間的轉移、歸併等，導致各類志書、多樣性編目專著及科考報告等因各自所採用的分類系統不同，其科、屬和種級範疇的界定更是五花八門。顯然，各類植物分類學專著和志書的不同分類處理APG等新系統所導致的分類系統和分類處理的不一致給生命科學及農業、林業、醫藥和環境科學研究與保護以及政府管理工作者對植物名稱的使用帶來了不便甚至混亂。因此，綜合最新的植物分類學和系統學研究成果文獻以及APG等新系統，系統地整理雲南種子植物名錄顯得十分迫切，這項工作不僅是植物系統學學科發展的需要，也是生態學、生物多樣性與保護和生物地理學等學科進一步研究的基石。

本數據集在參考《雲南植物志》《Flora of China》等資料的基礎上，對雲南的種子植物科、屬、種進行系統而全面的收錄和匯總，儘可能地整合最新的研究成果，同時聽取各類群專家意見，整理出了一套完整的《雲南省種子植物物種名錄》（以下簡稱「《名錄》」）。

1 數據採集和處理方法

1.1 數據來源

本數據集的基礎數據主要來源於《雲南植物志》各卷冊和《雲南種子植物名錄》，同時補充了以下幾方面的內容：①《中國植物志》《Flora of China》《中國種子植物科屬詞典》等志書記載的雲南有分布的物種名稱。②最新發表的分類修訂、分子系統發育和雲南發現和發表的新類群和新記錄物種等期刊文獻中記錄的名稱。其中，雲南新種和新記錄文獻收集自1984年後迄今。③出版的雲南省境內的地方植物志、保護區科考報告、區域性生物多樣性專著（如《橫斷山高山冰緣帶種子植物》）等記錄的物種名稱。④中國科學院昆明植物研究所標本館（KUN）、中國科學院植物研究所標本館（PE）、中科院成都生物研究所標本館（CDBI）、四川大學生命科學學院植物標本館（SZ）、中國科學院西北高原生物研究所青藏高原生物標本館（HNWP）、西雙版納植物園標本館（HITBC）、雲南大學標本館（YUKU）、西南林業大學標本館（SWFC）等標本館，以及中國數字植物標本館（CVH，http://www.cvh.org.cn）、国家标本平台（NSII，http://www.nsii.org.cn/2017/home.php）、中国自然标本馆（CFH，http://www.nature-museum.net）等网络数据中记录的云南分布的物种名称。⑤最后，我们还整合了我们近年的野外考察成果和专家建议的观点。对于历史上曾经出现过的，但在《雲南植物志》《中國植物志》《Flora of China》中未提及或處理為異名的屬種名稱，如《科屬詞典》《中國被子植物科屬綜論》及國內分類學相關期刊中出現的名稱，我們也儘可能地加以收錄，並作為原始數據。同時，我們也儘可能地收集了過去錯誤記載的雲南產和非雲南產名稱。此外，我們還糾正了存在名稱拼寫錯誤（主要見於《雲南植物志》《中國植物志》《Flora of China》及地方植物志或專著）的物種，如豨薟屬（Sigesbeckia）被錯誤拼寫為「Siegesbeckia」等。收錄以上所有物種名稱信息數據以便於後續處理。

1.2 數據審核方法、標準

（1）通過異名庫對所有名稱進行初步異名處理

通過Tropicos（http://www.tropicos.org）、The Plant List（http://www.theplantlist.org/）、物种2000（http://www.sp2000.cn/joaen/index.php）、Flora of China（http://www.efloras.org/flora_page.aspx?flora_id=2）等数据库平台进行初步异名匹配和处理。再由工作人员对所有的异名和无法匹配的名称逐一进行初审。据此整理出《雲南種子植物名錄》的學名列表及處理意見，以提交專家審核。

（2）參照最新的分子系統學和分類學成果決定啟用的名稱和系統位置

我們對科、屬範疇的界定儘量參照最新的分類學和系統學研究成果，裸子植物系統採用《Flora of China》系統，被子植物系統採用APG Ⅳ系統^[8]。

（3）優先採用相應類群的分類學專家的審核意見

考慮到不同的植物分類學家對其所研究的植物類群在分類學、系統學以及最新的研究進展等的掌握往往要遠多於非該類群的分類學家，對其所研究的植物類群往往具有更深的理解。故我們優先採用類群專家的意見，但專家對於我們所提出的處理意見如有不同意見，需要提供理由。

（4）《雲南植物志》發表的新物種處理原則

《雲南植物志》在編寫時命名了部分新物種。對於這部分名稱，我們通過查閱《雲南植物志》的原始描述，視其描述的情況作刪除或保留處理。所有被列入不合格發表的新物種，在本數據集中一律不予採納。

（5）種下等級處理原則

為了更加精細化體現雲南植物多樣性，我們採用變種或亞種的概念。並且，當一個種的種下有2個以上的亞種或變種，若僅僅是某變種／亞種（包括原變種／亞種）分布於雲南，則我們僅收錄該變種／亞種。但是在做物種統計時，若該物種僅有變種／亞種分布於雲南而其原變種/原亞種不分布於雲南時，我們將其作為種來統計。

（6）選用科屬種中文名的主要原則

選用的類群中文名優先依據2015年由環保部和中國科學院聯合發布的《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》中的中文名稱，但有所修訂。對於《中國生物多樣性紅色名錄·高等植物卷》因各種原因沒有記載或者無法匹配時，我們依次優先採用《雲南植物志》和《Flora of China》所記載的中文名。對於發表在英文期刊的新種和中國新記錄種沒有中文名的，我們根據種加詞的譯意新擬中文名。

1.3 審核流程

《名錄》審核分為工作組初審、專家會審和函評、終審三個流程。

（1）工作組初審

初審主要由工作組完成，即根據以上原則對雲南省記錄的所有物種名稱進行逐一審核。

（2）專家審核採用「會議評審」和「函評審核」兩種形式

會議評審：邀請雲南省內外有關植物分類學專家在中科院昆明植物所進行2次《名錄》專家審核會。專家組成員提出質疑，由工作組成員根據專家意見進行審核和修改。

函評審核：對因故不能參會的專家，以及一些專科專屬的專家，通過電子郵件的方式邀請專家對相應的科屬進行審核。由專家出具書面審核意見和建議。工作組據此進行修改、調整和完善。

（3）終審

所有審核意見匯總並修改完善後，工作組再根據專家的意見對所有名錄進行逐一核實、審校和完善，對名錄進行去除重複等處理，排除編輯和排版中出現的錯誤，最終擬定《名錄》初稿；同時完善審核依據，在提供每個物種的原始資料和信息的基礎上，形成最終評估報告，最後遞交專家委員會審定。

2 數據樣本描述

數據集包括雲南省種子植物253科2392屬16064種（含種下等級，不含種下等級的物種數為14538種）。其中，雲南省裸子植物9科25屬113種（含種下等級，不含種下等級的物種數為105種）；被子植物244科2 367屬15951種（含種下等級，不含種下等級的物種數為14433種）。數據內容由4部分數據組成，分別為拉丁科名、中文科名、學名、中文名。

圖片

圖片

圖2 雲南省被子植物數據集

3 數據質量控制和評估

為了保證數據的質量，在對雲南省種子植物評價和審核的過程中組建了顧問委員會、核心專家組、工作組。

顧問委員會：由中華人民共和國瀕危物種科學委員會、雲南瀕危物種科學委員會、中國科學院、雲南省環境保護廳、雲南省林業廳和雲南大學等高校的15位專家組成。其中，院士6位，對評估過程進行指導，並形成長效機制。

核心專家組：由國內外11個科研院所及高校的28位資深專家組成。其中，國際專家1人，具高級職稱24人。

工作組：由中國科學院昆明植物研究所和吉首大學研究人員組成。

4 數據價值

本數據集是迄今為止雲南省最權威、最準確的種子植物物種名錄，為今後開展雲南省種子植物的物種研究，生物多樣性的保護、科學利用、各級政府部門生物多樣性相關管理和決策提供了科學依據。

5 數據使用方法和建議

本數據集結構較為簡單，包含4個字段的信息，在Science Data Bank的鏈接地址為http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/489。如對名錄有超出數據集及所包含信息的需求，請聯繫本文通訊作者陳家輝或孫航，郵箱：chenjh@mail.kib.ac.cn，sunhang@mail.kib.ac.cn。目前本數據集已建成專題數據庫（http://bio360.kun.ac.cn/index/special），本数据库将持续进行数据更新和功能完善，以建成云南生物物种名录的信息服务平台。

致 謝

感謝參與雲南省種子植物名錄評估和審核工作的顧問委員會和核心專家組的所有人員提供的悉心指導和寶貴建議。

參考文獻

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2. WU Z, WU S. A proposal for a new floristic kingdom (realm): the E. Asiatic Kingdom, its delineation and characteristics[C]. Floristic characteristics and diversity of East Asian plants: proceedings of the first international symposium offloristic characteristics and diversity of East Asian plants, Beijing, China, 1988.
3. 萬本太, 徐海根, 丁暉, 等. 生物多樣性綜合評價方法研究[J]. 生物多樣性, 2007, 15（1）: 97–106.
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5. SU J, WANG W, ZHANG L, et al. Phylogenetic placement of two enigmatic genera, Borthwickia and Stixis, based on molecular and pollen data, and the description of a new family of Brassicales, Borthwickiaceae[J]. Taxon, 2012, 61: 601–611.
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8. THE ANGIOSPERM PHYLOGENY GROUP. An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV[J]. Botanical Journal of the Linnean Society, 2016, 181: 1–20.

數據引用格式

陳家輝, 鄧濤, 張代貴, 等. 雲南省種子植物名錄數據集[DB/OL]. Science Data Bank, 2017. (2018-01-16). DOI: 10.11922/sciencedb.489.