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2016–2018年四川省石渠縣鼠類包蟲病感染狀況數據集

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2016–2018年四川省石渠縣鼠類包蟲病感染狀況數據集
作者:姜路帆 鄭普陽 李波 郭聰 周訓軍 張琛 王勇 楊進榮 張美文 楊廷勇
2019年9月18日
本作品收錄於《中國科學數據
姜路帆, 鄭普陽, 李波,等. 2016–2018年四川省石渠縣鼠類包蟲病感染狀況數據集[J/OL]. 中國科學數據, 2019, 4(3). (2019-03-29). DOI: 10.11922/csdata.2019.0003.zh.


摘要&關鍵詞

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摘要:四川省甘孜藏族自治州的石渠縣包蟲病發病率位居全國之首,半數家庭遭受包蟲病的折磨。因其高感染率和高致死率,藏區人稱之為「蟲癌」。包蟲病的防治和扶貧並列為該縣的兩大政治任務。中國科學院亞熱帶農業生態研究所野生動物生態研究團隊於2016–2018年在石渠縣選取包蟲病發病率高的鄉鎮,於城鎮外3公里內的草場使用夾捕法,對捕獲的鼠進行解剖並記錄繁殖狀況,對病變臟器進行取樣。另外結合石渠縣開展的大面積滅鼠,收集滅鼠後的死鼠,解剖觀察鼠對包蟲病的感染情況。本數據集包含了石渠縣853隻高原鼠兔與青海田鼠的繁殖與染病情況等信息1萬餘條。本數據集的建設有利於探究包蟲病的傳播機制,為包蟲病的防治提供數據支撐,同時對高原鼠害的監控與防治也有積極的作用。

關鍵詞:石渠縣;包蟲病;高原鼠兔;青海田鼠;繁殖狀況

Abstract & Keywords

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Abstract: Located in Sichuan Ganzi Tibetan Autonomous Prefecture, Shiqu County has the highest incidence of echinococcosis in China, where half of the households suffer from echinococcosis. Because of its high infection rate and high mortality rate, echinococcosis is called 「bug cancer」 by people in Tibetan areas. The prevention and treatment of echinococcosis is paralleled to poverty alleviation among the local government’s major two priorities. Rodent is said to be one of infection vectors, so we have done some investigation about local rodent. We selected towns with high incidences of echinococcosis in Shiqu County in 2016 – 2018. We trapped rodents on the grassland within 3 km centering the town. We then dissected them, recorded the reproduction status, and sampled the diseased organ. In addition, rodent control was carried out over a large area in Shiqu, the resultant dead bodies were collected, and the echinococcosis was observed and dissected for its infection capability. This dataset contains more than 10,000 pieces of information on the reproduction and disease infection of 853 plateau pika and Qinghai vole in Shiqu County. This dataset is conducive to exploring the transmission mechanism of echinococcosis, providing data support for the prevention and treatment of echinococcosis, and it also has a positive effect on the monitoring and prevention of plateau rodents.

Keywords: Shiqu County; hydatid disease; Ochotona curzoniae; Lasiopodomys fuscus; reproductive status

數據庫(集)基本信息簡介

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數據庫(集)名稱 2016–2018年四川省石渠縣鼠類包蟲病感染狀況數據集
數據作者 姜路帆,鄭普陽,李波,郭聰,周訓軍,張琛,王勇,楊進榮,張美文,楊廷勇
數據通信作者 周訓軍(zhouxj@isa.ac.cn)
數據時間範圍 2016–2018年
地理區域 四川省甘孜藏族自治州石渠縣(97°20′–100°25′E,36°19–31°24′N)。
數據量 0.20 MB
數據格式 *.xlsx
數據服務系統網址 http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/727
基金項目 農作物病蟲鼠害疫情監測與防治經費項目(13162130108235004);中國科學院信息化專項「科學大數據工程」農業多尺度病蟲害圖像重點數據庫建設與應用服務(XXH13505-03-104)。
數據庫(集)組成 本數據集由2部分數據組成,其一為鼠類數量調查數據,其二是鼠類解剖數據。其中:鼠類數量調查數據包括時間、氣候、生境、數量等;鼠類解剖數據包括性別、體重、體長、尾長、宮角狀況、胚胎數、宮斑數、睾丸位置、睾丸大小等。

Dataset Profile

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Title Dataset of rodent echinococcosis infection status in Shiqu County, Sichuan Province, 2016 – 2018
Data corresponding author Zhou Xunjun (zhouxj@isa.ac.cn)
Data authors Jiang Lufan, Zheng Puyang, Li Bo, Guo Cong, Zhou Xunjun, Zhang Chen, Wang Yong, Yang Jinrong, Zhang Meiwen, Yang Tingyong
Time range 2016 – 2018
Geographical scope Shiqu County, Ganzi Tibetan Autonomous Prefecture, Sichuan Province (97°20』E – 100°25』E, 36°19』N – 31°24』N).
Data volume 0.20 MB
Data format *.xlsx
Data service system <http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/727>
Sources of funding Crop disease, pest and disease epidemic monitoring and prevention fund project (13162130108235004); Construction and application of key database of agricultural multi-scale pest and disease images in the 「Science Big Data Project」 of the Chinese Academy of Sciences (XXH13505-03-104).
Dataset composition This dataset consists of two parts of data, including rodent quantitative survey data, and rodent anatomical data. Among them: the quantitative survey data include time, climate, habitat, quantity, etc.; the anatomical data include gender, body weight, body length, tail length, uterine angle status, number of embryos, number of plaques, testicular position, testicular size, etc.


引 言

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包蟲病是棘球蚴病(Echinococcosis)的俗稱,是棘球屬絛蟲的幼蟲感染人或動物所引起的人畜共患寄生蟲病。已確認的棘球絛蟲屬有5個種[1][2],在公認感染人體的4種棘球絛蟲中,以細粒棘球絛蟲(Echinococcus granulosus)和多房棘球絛蟲(Echinococcus multilocularis)分布最廣、危害較大,其幼蟲分別可引起細粒棘球蚴病和多房棘球蚴病[3]。兩型包蟲病是以牧業為主地區的人畜常見病、多發病,病灶主要發生於宿主的肝臟、肺臟、腦等器官,導致這些器官的占位性病變及其相關損害。人體泡型包蟲病若不治療,病死率很高[4]。我國22省區有此病,高發省區是新疆、寧夏、青海、甘肅、西藏、四川西部、內蒙等[5]。四川省甘孜藏族自治州的石渠縣包蟲病發病率位居全國之首,半數家庭遭受包蟲病的折磨。因其高感染率和高致死率,藏區人稱之為「蟲癌」。包蟲病的防治和扶貧並列為該縣的兩大政治任務。

根據以前的數據資料,包蟲病循環的研究大多關於犬類以及牛羊等牲畜。本數據集的建設,為探究包蟲病的野外循環鏈補充了重要的一部分——高原齧齒類動物。同時,對於探究高原鼠類的繁殖狀況,對高原鼠害進行監控與防治也有着積極的作用。

1 數據採集和處理方法

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1.1 數據採集方法

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數據的採集方式主要有兩種:(1)每年8月,由工作人員來到四川省甘孜藏族自治州石渠縣,採用夾捕法,用江西貴溪李氏捕鼠器械有限公司廠生產的弓形夾200個,大號鋼板夾60個。弓形夾放置於高原鼠兔洞口,鋼板夾主要放置於青海田鼠洞口,每隔1–2小時巡視一次,收集捕獲的鼠類。當天解剖捕獲的樣本,記錄體長、尾長、體重、性別、生殖狀況等指標。體長測量精確到1 mm,體重、胴體重稱量採用便攜式電子天平,稱量精確度為0.1 g。並檢查內臟是否感染包蟲病,進行病變器官取樣。(2)每年4月,石渠縣開展大滅鼠活動,由工作人員收集滅鼠後的死鼠進行解剖,記錄體長、尾長、體重、性別、生殖狀況等指標。體長測量精確到1 mm,體重、胴體重稱量採用便攜式電子天平,稱量精確度為0.1 g。檢查內臟是否有感染包蟲病,病變器官取樣。數據採集的地點分別在中國四川省甘孜藏族自治州石渠縣德榮瑪鄉33°06′N,97°96′E;阿日扎鎮32°97′N,98°36′E;尼呷鎮32°95′N,98°05′E;格孟鄉33°22′N,98°07′E。

1.2 數據預處理

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數據採集完成後,由工作人員將數據輸入Excel並保存。

2 數據樣本描述

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本數據集由兩部分數據組成,其一為鼠類數量調查數據,包括時間、氣候、生境、數量等(表1);另一部分為鼠類解剖數據,包括性別、體重、體長、尾長(高原鼠兔無尾長)、宮角狀況、胚胎數、宮斑數、睾丸位置、睾丸大小等(表2、表3)。


表1 鼠類數量記錄表

置夾時間 夜間氣候 生境 分種計數 鼠數
高原鼠兔 青海田鼠
4–5日 草甸 13 0 13
5–6日 草甸 33 0 33
小計 46 0 46


表2 高原鼠兔解剖記錄表

編號 性別 全體重(g) 胴體重(g) 體長(mm) 宮角狀況 胚胎 宮斑 睾丸 感染狀況
大小(mm) 顏色 大小(mm)
SQGM201808001ST 2 127.0 88.0 169 1 2
SQGM201808002ST 2 140.0 89.0 178 1 2
SQGM201808003ST 2 175.0 117.0 201 4 1 2
SQGM201808004ST 1 135.0 97.0 183 1 2×4 2
SQGM201808005ST 2 139.0 89.0 187 5 1 1
SQGM201808006ST 2 124.0 72.0 164 1 2
SQGM201808007ST 1 176.0 123.0 186 2 5×8 2
SQGM201808008ST 1 158.0 99.0 186 2 3×5 2
SQGM201808009ST 2 134.0 80.0 176 1 2
SQGM201808010ST 1 155.0 104.0 188 2 5×7 1
SQGM201808011ST 2 144.0 91.0 173 2 2
SQGM201808012ST 1 137.0 92.0 180 2 3×5 2
SQGM201808013ST 1 160.0 115.0 194 2 5×9 1
SQGM201808014ST 1 131.0 78.0 169 2 3×6 2
SQGM201808015ST 1 174.0 122.0 193 2 5×8 2

註:編號規則是「石渠+具體地名+年月+捕獲只數編號+鼠種」(如SQ:石渠;GM:格孟鄉;201808:2018年8月;001代表第一隻;ST:高原鼠兔);性別(1=♂,2=♀);宮角狀況(1=線狀,2=管狀,3=剛產);宮斑顏色(1=黑色,2=黃色);睾丸位置(1=腹位,2=回位,3=下位);感染狀況(1=是,2=否)。


表3 青海田鼠解剖記錄表

編號 性別 全體重(g) 胴體重(g) 體長(mm) 尾長(mm) 宮角狀況 胚胎 宮斑 睾丸 感染狀況
大小(mm) 顏色 大小(mm)
SQGM201808001TS 2 34.6 23.0 108 31 1 2
SQGM201808002TS 2 37.5 25.0 103 26 1 2
SQGM201808003TS 1 59.6 40.0 124 33 2 6×8 2
SQGM201808004TS 1 41.5 32.0 122 31 1 1×2 2
SQGM201808005TS 2 63.2 42.0 122 35 2 2
SQGM201808006TS 1 39.7 28.0 106 28 1 1×2 2
SQGM201808007TS 1 25.9 15.0 83 26 1 1×2 2
SQGM201808008TS 2 70.0 42.0 139 40 3 7 1 2
SQGM201808009TS 2 82.0 43.0 130 38 3 7 12×20 2
SQGM201808010TS 2 56.0 32.0 128 39 1 1 2

註:編號規則是「石渠+具體地名+年月+捕獲只數編號+鼠種」(如SQ:石渠;GM:格孟鄉;201808:2018年8月;001代表第一隻;TS:青海田鼠);性別(1=♂,2=♀);宮角狀況(1=線狀,2=管狀,3=剛產);宮斑顏色(1=黑色,2=黃色);睾丸位置(1=腹位,2=回位,3=下位);感染狀況(1=是,2=否)。

3 數據質量控制和評估

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本數據集主要來源於野外採樣,體重稱量使用便攜式電子天平,精確度為0.1 g;體長、胚胎大小、睾丸大小測量使用直尺,精確1 mm。一方面測量時為一人讀取數據,一人監察,一人記錄數據,並互相核實(大聲重複),數據均為人工紙質記錄,錄入電子數據時經多次核查,以保證數據質量。另一方面將野外肉眼觀察凝視感病的組織樣本取回帶回實驗室做病理學切片觀察(圖1),進一步確認是否感染包蟲病(圖2),從而確保數據的可靠性和準確性。空缺值代表未捕獲到和未觀察到。


圖片

圖1 肉眼觀察病變組織部分樣本圖片


[CSD-2019-003R3圖2 組織鏡檢部分樣本圖片.png 圖片]

圖2 組織鏡檢部分樣本圖片


4 數據價值

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以往國內外關於包蟲病傳播的研究主要集中於犬科動物以及牛羊等牲口上,對於齧齒類動物在包蟲病循環鏈中的作用及地位尚不明確。本數據集採集了高原優勢鼠種高原鼠兔與青海田鼠的繁殖與染病數據,有利於探究包蟲病的傳播機制,更進一步研究鼠類攜帶包蟲病的機制。同時對於高原鼠害的監控和防治也有積極意義。

參考文獻

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  1. THOMPSON R C, MCMANUS D P. Towards a taxonomic revision of the genus Echinococcus [J]. Trends in Parasitology, 2002, 18(10): 452-457.
  2. XIAO N, QIU J M, NAKAO M, et al. Biological features of a new Echinococcus species (Echinococcus shiquicus) in the east of Qinghai-Tibet Plateau[J]. Chinese journal of parasitology & parasitic diseases, 2008, 26(4): 307-312.
  3. 肖寧, 邱加閩, NAKAO M, 等. 青藏高原東部地區發現的新種:石渠棘球絛蟲的生物學特徵[J]. 中國寄生蟲學與寄生蟲病雜誌, 2008, 26(4): 307-312.
  4. 邱加閩, 劉鳳潔, Peter S, 等. 四川西部藏區包蟲病流行病學研究——Ⅰ.囊型包蟲病與泡型包蟲病人群感染特點與分布趨勢[J]. 中國人獸共患病學報, 2000, 16(2): 77-80.
  5. 高鐵君, 張遵哲, 周悌, 等. 淺述我國包蟲病防治研究現狀[J]. 寧夏醫學雜誌, 1987(5): 310-312.

數據引用格式

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姜路帆, 鄭普陽, 李波,等. 2016–2018年四川省石渠縣鼠類包蟲病感染狀況數據集[DB/OL]. Science Data Bank, 2019. (2019-02-22). DOI: 10.11922/sciencedb.727.


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